已有的数据分析显示,许多多样的生物体表现型,包括疾病,都表现出男普遍性相互似之处的特征。这些男普遍性相互似之处被并不相同持续普遍性地所致荷尔蒙、普遍性细胞核、蛋白质型×男普遍性物理现象、行为相互似之处和环境暴露出的相互似之处。然而,至今为止,它们的程序和基本生物体学原理在很大持续普遍性上仍然是相互符的。
蛋白质型-一个组织表示(GTEx)单项提供了一个急于,让我们可以通过数据分析许多以前未曾以这种方式为并不一定的一个组织,来探索生物体核苷酸组中都男普遍性相互似之处的普遍普遍性和基因型程序。
最近,数据分析职员在Science杂志发文。为了并不一定生物体核苷酸组及其介导的男普遍性相互似之处,并辨认出男普遍性和基因型如何相互互阻碍多样的表现型和疾病,数据分析职员在GTEx单项(v8信息发布)清查的44个生物体一个组织相互关联中都生成了蛋白质表示及其基因型介导的男普遍性相互似之处目录,并分析了16245个RNA高通量比对和838个成年个体的蛋白质型。
在此新,数据分析职员年度报告了蛋白质表示技术水平、一个组织细胞类别组成和官能团表示定量表现型核苷酸(cis-eQTLs)的男普遍性相互似之处。为了评估它们的阻碍,数据分析职员将这些结果与87个GWAS的蛋白质功能普遍性、核苷酸q相互辅相互成注解和全蛋白质组共同点数据分析(GWAS)简介统计相互相互辅相互成。
表明,男普遍性对蛋白质表示的阻碍是无处不在的 (在所有一个组织中都,数据分析职员鉴定了13 294个有男普遍性相互似之处的蛋白质)。然而,这些阻碍很小,而且主要是一个组织依赖普遍性的。
具有男普遍性相互似之处表示的蛋白质主要不是由一个组织依赖普遍性蛋白质表示涡轮的,而是加入了一系列多样化的生物体功能普遍性,如药物和内分泌反应、生殖细胞和一个组织其本质发生、生殖、普遍性生殖和精子发生、脂肪新陈代谢、癌症和免疫反应等。
而X连接蛋白质在女普遍性中都表示低,指引了逃避X细胞核失活的候选蛋白质,时常细胞核蛋白质的男普遍性取向普遍性表示指引了与内分泌相互关的核苷酸q介导和额外核苷酸q的作用,以及并不一定基因型标识的男普遍性相互似之处普遍性属,除此以外是核酸H3 Lys27三丝氨酸(H3K27me3)。
蛋白质表示的基因型介导的男普遍性相互似之处要少得多(在所有一个组织中都鉴定出了369个男普遍性取向的eQTL),并且具有总体的一个组织依赖普遍性。数据分析职员辨认出了58个由单一男普遍性的蛋白质表示基因型介导涡轮的蛋白质-表现型共同点。这些包括男普遍性相互似之处的细胞类别丰度抑制蛋白质型-表现型共同点的核苷酸,以及男普遍性显然在共同点的潜在分子程序中都体现更从外部作用的核苷酸。例如,数据分析职员在肾脏中都辨认出了一个女普遍性依赖普遍性的六嘌呤HKDC1的eQTL,它阻碍怀孕女普遍性的脂肪酸新陈代谢,随后看出在氏族的出生体重上。
因此,通过将GTEx信息的男普遍性意识分析与蛋白质功能普遍性和核苷酸q相互辅相互成注解相互牵头,数据分析职员描述了导致生物体核苷酸组和eQTLs男普遍性相互似之处的一个组织依赖普遍性和一个组织对等的涡轮状况和程序。
数据分析职员辨认出了多个男普遍性相互似之处的蛋白质表示物理现象,这些物理现象与多样的表现型基因型共同点共轭,从而倡导了GWAS讯号的机理阐释。
由于许多表现型的致病一个组织是相互符的,因此对多样化的GTEx一个组织收集的分析可以作为清查男普遍性偏倚表现型基础的有力能源。这项社会活动对生物体核苷酸组的男普遍性相互似之处及其基因型介导完成了广泛的并不一定。
原始注解:
Meritxell Oliva et al. The impact of sex on gene expression across human tissues. Science (2020). DOI: 10.1126/science.aba3066
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